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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

充当“影子股东”聚钱敛财的落马官员被公诉******

　　中新社北京1月5日电 (记者张素)中国最高人民检察院5日通报，海南检方对海南省自然资源和规划厅原党组成员、副厅长吴开成涉嫌受贿案提起公诉。

　　公开资料显示，吴开成生于1966年4月，海南海口人，1988年4月加入中国共产党，1989年8月参加工作。2022年10月，官方通报其严重违纪违法被开除党籍和公职。他被指贯彻落实党中央关于生态环境保护的重大决策部署打折扣、搞变通，并被指“靠矿吃矿、坐地生财”“充当‘影子股东’聚钱敛财”等。

　　中央纪委国家监委网站近日刊文指出，腐败分子贪腐手段花样翻新，如有的通过“影子公司”“影子股东”，投资或实际控制公司及代收代持股份收益谋利等。文章称，应从利用企业工商档案查实际的控制人、通过查资产情况找利益输送链、透过公司经营业务看背后的公权力等方面入手严查这类案件。

　　另据最高检通报，安徽检方对安徽省信用担保集团有限公司原党委书记、董事长吴学民涉嫌受贿、国有公司人员滥用职权案提起公诉；对安徽省合肥市原副市长、市城乡建设局原局长姚凯涉嫌受贿案提起公诉。

　　公开资料显示，吴学民生于1968年2月，河北青龙人，1990年7月参加工作，2003年6月加入中国共产党。在被“双开”的通报中，他被指“三观极度扭曲，贪欲极度膨胀，置管党治党主体责任及金融安全于不顾”，以及“靠金融吃金融”“热衷觥筹交错”等。

　　姚凯生于1969年12月，安徽庐江人，1990年8月参加工作，1998年4月加入中国共产党。在被“双开”的通报中，他被指“违规拥有非上市公司股份”，以及“公然利用执掌城建工程项目职权，与不法商人相互勾连，吃里扒外”等。

　　安徽省纪委监委日前公开通报违反中央八项规定精神典型问题，涉及上述二人。2013年至2021年，姚凯先后收受多名管理服务对象所送礼金、购物卡和高档酒水、虫草等礼品，折合共计84.4万元(人民币，下同)，他还多次接受私营企业主安排携家人旅游。吴学民则在2014年至2022年先后收受多名管理服务对象所送礼品、礼金、购物卡、提货券等折合共计122.17万元。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）